「魔装機神2」では一度ゲームを最後までクリアすると、クリア後にセーブデータを保存するかどうかの項目が出ます。
ここでセーブデータを保存し、新たにプレイする時にロードから保存したデータを選ぶと、クリアしたことによる特典が得られます。
特典の内容は次の通り。主に育成データなどの引き継ぎが行われます。
合わせて『クリア後のおまけ』もご覧ください。