「魔装機神2」では、機体を100%まで改造をすると、機体の性能が大幅にアップします。
この性能アップは、自動的に行われます。
「スーパーロボット大戦」シリーズのように、特定の項目を選んで性能を上げるというようなものはありません。
性能アップは機体の特殊能力の変化に現れます。
また、全ての機体が、それぞれ現在の属性のランクから1ランク上にアップし、同じ敵と戦う時でも優位に戦闘を行うことができるようになります。
ここでは特殊能力の変化を一覧で紹介します。
HP回復30%になる機体は優先して強化していくと、攻略が楽になります。
| 主要機体 | ||
| 機体名 | 強化前 | 100%強化後 |
| サイバスター | HP回復10% MG回復5 |
HP回復30% MG回復5 |
| ヴァルシオーネR | HP回復10% MG回復5 |
HP回復30% MG回復5 |
| グランヴェール | HP回復10% MG回復5 |
HP回復10% MG回復30 |
| ガッデス | 修理能力 HP回復10% MG回復5 |
修理能力 HP回復10% MG回復30 |
| ザムジード | HP回復10% MG回復5 |
HP回復30% MG回復5 |
| 前作引き継ぎ機体 | ||
| 機体名 | 強化前 | 100%強化後 |
| ガルガード | MG回復10 | MG回復30 |
| ギオラスト | MG回復5 | MG回復5 |
| ザイン | 修理能力 MG回復5 |
修理能力 HP回復30% MG回復30 |
| ジェイファー | MG回復10 | MG回復30 |
| ジャオーム | MG回復5 | HP回復30% MG回復5 |
| ディアブロ | HP回復10% MG回復5 |
HP回復30% MG回復5 |
| ノルス・レイ | 修理能力 補給能力 MG回復5 |
修理能力 補給能力 HP回復30% MG回復5 |
| ファルク | 修理能力 MG回復5 |
修理能力 MG回復30 |
| ラ・ウェンター | 補給能力 HP回復10% MG回復5 |
補給能力 HP回復30% MG回復30 |
| ラストール | 修理能力 MG回復5 |
修理能力 MG回復5 |
| 今作初登場機体 | ||
| 機体名 | 強化前 | 100%強化後 |
| ソルガディ | MG回復5 | MG回復30 |
| ディンフレイル | MG回復10 | HP回復30% MG回復30 |
| デルギラン | 補給能力 HP回復10% MG回復5 |
補給能力 HP回復30% MG回復30 |
| レオゲイラ | MG回復10 | MG回復30 |
| シュウ関連機体 | ||
| 機体名 | 強化前 | 100%強化後 |
| グランゾン | HP回復20% MG回復20 |
HP回復20% MG回復20 |
| ウィゾール改 | HP回復20% MG回復20 |
HP回復20% MG回復20 |
| ガディフォール | MG回復5 | HP回復30% MG回復5 |
| その他機体 | ||
| 機体名 | 強化前 | 100%強化後 |
| キョウメイ朱 | HP回復10% MG回復10 |
HP回復10% MG回復10 |
| キョウメイ蒼 | HP回復10% MG回復10 |
HP回復10% MG回復10 |
| スヴェンド・ニーダム | HP回復10% MG回復5 |
HP回復10% MG回復5 |